RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD1BP29016 333 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSPA4P34932 840 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARL3P36405 182 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC1A3P43003 542 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NRIP1P48552 1158 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CASP6P55212 293 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDH13P55290 713 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 BCL2L1Q07817 233 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNTN1Q12860 1018 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 EMC2Q15006 297 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAP9Q49MG5 647 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 EOGTQ5NDL2 527 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRUNE1Q86TP1 453 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTC30BQ8N4P2 665 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IL17REQ8NFR9 667 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC26A7Q8TE54 656 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCFD2Q8WU76 684 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LPGAT1Q92604 370 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FRZBQ92765 325 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 C16orf58Q96GQ5 468 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TSNARE1Q96NA8 513 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL21A1Q96P44 957 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTYH2Q9BSA4 534 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NACAP1Q9BZK3 213 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR51J1Q9H342 316 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q9H3A6 140 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PREBQ9HCU5 417 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 APMAPQ9HDC9 416 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEC14L4Q9UDX3 406 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NSG2Q9Y328 171 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGF2RP11717 2491 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.15□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CENPFP49454 3210 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CACNA1DQ01668 2161 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A096LNJ9 63 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A1W2PPQ1 181 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NKX2-6A6NCS4 301 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANHXE9PGG2 379 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 G3V3Y1 287 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SUPT7LO94864 414 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 RCBTB2O95199 551 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUDT14O95848 222 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 RETP07949 1114 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MMP10P09238 476 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUDT17P0C025 328 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FOSL2P15408 326 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACP1P24666 158 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 POU3F4P49335 361 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ASCL1P50553 236 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MNAT1P51948 309 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PNLIPRP2P54317 469 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 BACE1P56817 501 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUP107P57740 925 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ROR1Q01973 937 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM219BQ5XKK7 198 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SASS6Q6UVJ0 657 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF730Q6ZMV8 503 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 IKBIPQ70UQ0 350 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NLRP14Q86W24 1093 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 AMIGO1Q86WK6 493 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 LAX1Q8IWV1 398 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPR65Q8IYL9 337 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GRK7Q8WTQ7 553 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CRYGNQ8WXF5 182 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MYDGFQ969H8 173 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PYCR2Q96C36 320 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM101Q96IK0 257 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MBOAT4Q96T53 435 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 POLR3GLQ9BT43 218 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 CARD9Q9H257 536 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TNMDQ9H2S6 317 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF446Q9NWS9 450 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAS2R16Q9NYV7 291 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GGA3Q9NZ52 723 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 MLXQ9UH92 298 aa0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPR52Q9Y2T5 361 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms