RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524295.5

LINC01933-204, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1933, human

TSL 2 BASIC

Gene LINC01933, Length 3,591 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01933-204	ENST00000524295	ITGAM	P11215	1152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SRC	P12931	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PAX1	P15863	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CTGF	P29279	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	EPHA2	P29317	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	HNMT	P50135	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	NTHL1	P78549	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TEAD2	Q15562	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	NKG7	Q16617	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DCST1	Q5T197	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	RELT	Q969Z4	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ARNTL	O00327	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	WNT9A	O14904	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	LAT	O43561	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	GREM1	O60565	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SEMA3D	O95025	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SOD2	P04179	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	GADD45A	P24522	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PDHA2	P29803	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	RAB25	P57735	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ZNF273	Q14593	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DPP10	Q8N608	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	SOCS5	O75159	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01933-204	ENST00000524295	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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