RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515708.5

TSPAN17-209, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-209ENST00000515708 MMP28Q9H239 520 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 HCN2Q9UL51 889 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ANHXE9PGG2 379 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 HMGN4O00479 90 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SH3BP5O60239 455 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 LGI1O95970 557 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 IL1AP01583 271 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 HSPB3Q12988 150 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ASAH1Q13510 395 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TRIM60Q495X7 471 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 USP30Q70CQ3 517 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 C6orf120Q7Z4R8 191 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 IL17FQ96PD4 163 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 DKK3Q9UBP4 350 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 HMX3A6NHT5 357 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PDPK1O15530 556 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MMP20O60882 483 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 LILRB3O75022 631 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 C8AP07357 584 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MSL3P1P0C860 447 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SYN1P17600 705 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MAPK12P53778 367 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 FAM129CQ86XR2 697 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MSLNLQ96KJ4 702 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 NELL2Q99435 816 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SLC22A4Q9H015 551 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 AHSPQ9NZD4 102 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 C5AR2Q9P296 337 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ANKRD34BA5PLL1 514 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 K7ESM1 405 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PI15O43692 258 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 NNMTP40261 264 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 VEGFBP49765 207 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 DAB2P98082 770 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CDK10Q15131 360 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SYT14P1Q58G82 188 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 C22orf42Q6IC83 251 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ZNF366Q8N895 744 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TMEM203Q969S6 136 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 DTD2Q96FN9 168 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 RAB36O95755 333 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CSF3P09919 207 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CPEP16870 476 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CXCR2P25025 360 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ETV5P41161 510 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ETV1P50549 477 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SMIM11AP58511 58 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 CNTN1Q12860 1018 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 XKRXQ6PP77 449 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 KRT78Q8N1N4 520 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-209ENST00000515708 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms