RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PHEXP78562 749 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 MROH9Q5TGP6 573 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CYP20A1Q6UW02 462 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 LIX1LQ8IVB5 337 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 UCN3Q969E3 161 aa15.58■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 PROK2Q9HC23 129 aa15.58■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 SNX15Q9NRS6 342 aa15.58■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.58■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 LRATO95237 230 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 FBXO45P0C2W1 286 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.57■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 SERPINB3P29508 390 aa15.57■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 SLC37A1P57057 533 aa15.57■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 GTF2H2Q13888 395 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 ACAP2Q15057 778 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CES4AQ5XG92 561 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 IPPKQ9H8X2 491 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 A0A096LPK6 155 aa15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CCDC189A1A4V9 331 aa15.56■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 CLPSP04118 112 aa15.56■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM64Q6YI46 380 aa15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 NUDT13Q86X67 352 aa15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 HIVEP1P15822 2718 aa15.55■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.55■□□□□ 0.08
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HERC3-211ENST00000513325 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.55■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.55■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.55■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.54■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 PGRMC2O15173 223 aa15.54■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 ZWINTO95229 277 aa15.54■□□□□ 0.08
HERC3-211ENST00000513325 CLDN9O95484 217 aa15.54■□□□□ 0.08
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