RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	DDOST	P39656	456 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SLC7A6	Q92536	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	SOCS5	O75159	536 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	RLN2	P04090	185 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	HNF1B	P35680	557 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	KCNC1	P48547	511 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	UPP1	Q16831	310 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PKD1-222	ENST00000496574	PTN	P21246	168 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ADRA1A	P35348	466 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM19	Q96HH6	336 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NUP98	P52948	1817 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF30	P17039	623 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		Q6ZVL8	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FATE1	Q969F0	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	E2F3	O00716	465 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HPGDS	O60760	199 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KRT33A	O76009	404 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TF	P02787	698 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PDGFA	P04085	211 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ADH1A	P07327	375 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RAB3B	P20337	219 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CEP68	Q76N32	757 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KCNN1	Q92952	543 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		M0R036	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RASGRP1	O95267	797 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CDC20	Q12834	499 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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