RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 CENPBD1B2RD01 187 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 M0QX08 132 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PPM1DO15297 605 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IDH3BO43837 385 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SEMA3DO95025 777 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KRT8P05787 483 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CYC1P08574 325 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCKBRP32239 447 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PTGER1P34995 402 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DRD3P35462 400 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TIE1P35590 1138 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GNG2P59768 71 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CDK3Q00526 305 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CDONQ4KMG0 1287 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PNCKQ6P2M8 343 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CBLL1Q75N03 491 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FZD3Q9NPG1 666 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KRT84Q9NSB2 600 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 USE1Q9NZ43 259 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NCDNQ9UBB6 729 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC1A7O00341 560 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KCNJ13O60928 360 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ANGPTL1O95841 491 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HTR1AP08908 422 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FURINP09958 794 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IL32P24001 234 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RRM2P31350 389 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MAGEA2P43356 314 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BMXP51813 675 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R38P59533 333 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DPTQ07507 201 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MAPK11Q15759 364 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PDZD3Q86UT5 571 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SPARTQ8N0X7 666 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC15A4Q8N697 577 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 COQ8BQ96D53 544 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AMBNQ9NP70 447 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRB8 838 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ABCB7O75027 752 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 INMTO95050 263 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCDC159P0C7I6 412 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GIMD1P0DJR0 217 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FPR1P21462 350 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 KELP23276 732 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB1P30740 379 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MAPK9P45984 424 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G16P53816 162 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DSTNP60981 165 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CFHR1Q03591 330 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZNF33BQ06732 778 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EPS8Q12929 822 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CDK5R2Q13319 367 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DNASE1L3Q13609 305 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DGCR6Q14129 220 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CST6Q15828 149 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IGSF11Q5DX21 431 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 XAF1Q6GPH4 301 aa6.65□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.65□□□□□ -1.35
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