RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ADORA3P0DMS8 318 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MATKP42679 507 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A1Q14916 467 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CEBPEQ15744 281 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 HAGHQ16775 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ECSCRQ19T08 205 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NCLNQ969V3 563 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf52Q96A22 123 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DPH5Q9H2P9 285 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DCTPP1Q9H773 170 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NOTCH4Q99466 2003 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYM6O95789 1325 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NCAPD2Q15021 1401 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NDC80O14777 642 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D1BO14796 132 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF9O43307 516 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 GSTA1P08263 222 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NPY2RP49146 381 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SCGB2A2Q13296 93 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 GPR142Q7Z601 462 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 VPS36Q86VN1 386 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB118Q96PH6 123 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ECT2Q9H8V3 914 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FBP2O00757 339 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CFLARO15519 480 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 HEXBP07686 556 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CD1DP15813 335 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FUT1P19526 365 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A6P48664 564 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 TKTL1P51854 596 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MTTPP55157 894 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PEX3P56589 373 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCEQ02156 737 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NECTIN1Q15223 517 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ARSKQ6UWY0 536 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MCM10Q7L590 875 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CAPNS2Q96L46 248 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ACCSQ96QU6 501 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 STRADBQ9C0K7 418 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PARLQ9H300 379 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SP140LQ9H930 580 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 WDR41Q9HAD4 459 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 THYN1Q9P016 225 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 THEGQ9P2T0 379 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MIOXQ9UGB7 285 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF175Q9Y473 711 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 KIF3AQ9Y496 699 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 GUCA1CO95843 209 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 RNF224P0DH78 156 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PRDX2P32119 198 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ID1P41134 155 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ATP12AP54707 1039 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CALCOCO2Q13137 446 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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