RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	XKRX	Q6PP77	449 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	AGAP11	Q8TF27	550 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB9	Q96C00	473 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SGCZ	Q96LD1	299 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL1	Q9NR64	748 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		16.06	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MANBA	O00462	879 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PROM1	O43490	865 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCY1B2	O75343	617 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PDYN	P01213	254 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	UROS	P10746	265 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF24	P17028	368 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	COL8A1	P27658	744 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	STT3A	P46977	705 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB4	P48594	390 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SLAMF1	Q13291	335 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	IMPG1	Q17R60	797 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FJX1	Q86VR8	437 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC15A4	Q8N697	577 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NUBPL	Q8TB37	319 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CSF3R	Q99062	836 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RUBCNL	Q9H714	662 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR41	Q9HAD4	459 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		16.05	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NOTCH2	Q04721	2471 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPP1	O14494	284 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GRK2	P25098	689 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ETV4	P43268	484 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC18A1	P54219	525 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN5	Q6U736	354 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT13	Q86X67	352 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF175	Q8N4F7	328 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TLCD1	Q96CP7	247 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGED4	Q96JG8	741 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MECR	Q9BV79	373 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HES7	Q9BYE0	225 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		16.04	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM120B	A0PK00	339 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR91	A4D1P6	747 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MVJ9	347 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf105	B2RV13	164 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL21	O00585	134 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	AZIN1	O14977	448 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX1	O43933	1283 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZG16	O60844	167 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR75	O95800	540 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV3-11	P04433	115 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TNNI3	P19429	210 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	BSG	P35613	385 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SMS	P52788	366 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF4	P78317	190 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PLIN5	Q00G26	463 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PMP22	Q01453	160 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF17	Q02223	184 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SULF2	Q8IWU5	870 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL20	Q96IG2	436 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST11	Q9NPF2	352 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HPF1	Q9NWY4	346 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF225	Q9UK10	706 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB4	Q9Y574	426 aa		16.03	■□□□□ 0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM22	Q9Y584	194 aa		16.03	■□□□□ 0.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms