RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 NEURL3Q96EH8 262 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SLC22A4Q9H015 551 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 IL36AQ9UHA7 158 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 PCM1Q15154 2024 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 PLXNA2O75051 1894 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SLC35F4A4IF30 521 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 MMP20O60882 483 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ZNF254O75437 659 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 RASGRP1O95267 797 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SOX14O95416 240 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 INHAP05111 366 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 RB1P06400 928 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ADRA2AP08913 450 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 LAG3P18627 525 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 DDOSTP39656 456 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CRYBB2P43320 205 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 DGKEP52429 567 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 LIM2P55344 173 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ZNF91Q05481 1191 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 FAPQ12884 760 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ASB15Q8WXK1 588 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TMEM19Q96HH6 336 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SNX7Q9UNH6 387 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.26□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 IRGMA1A4Y4 181 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 FFAR1O14842 300 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 PDPK1O15530 556 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SSX4O60224 188 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 IL1AP01583 271 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 IL7P13232 177 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ITGB7P26010 798 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TAP2Q03519 686 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 NDUFA9Q16795 377 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SAXO2Q658L1 398 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 DEF8Q6ZN54 512 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 GPR65Q8IYL9 337 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 LINC00471Q8N535 108 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 QRFPRQ96P65 431 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TMEM245Q9H330 911 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 DKK3Q9UBP4 350 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 HCN2Q9UL51 889 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 V9GYH0 126 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CDH23Q9H251 3354 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CCDC182A6NF36 153 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 HMX3A6NHT5 357 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CENPBD1B2RD01 187 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 FAM227AF5H4B4 570 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 KLHL18O94889 574 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 CDRT1O95170 752 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 RAB36O95755 333 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TYRP14679 529 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 DDCP20711 480 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 MAPK12P53778 367 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 19
PKP4-210ENST00000480171 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.25□□□□□ -1.09
PKP4-210ENST00000480171 KLHL22Q53GT1 634 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms