RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 TRBC2A0A5B9 178 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 TP53I11O14683 189 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 RAMP1O60894 148 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ZNF708P17019 499 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 14.1
USP11-208ENST00000480104 FMO4P31512 558 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 LIMS1P48059 325 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 CDH11P55287 796 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 GFRA1P56159 465 aa10.64□□□□□ -0.71
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USP11-208ENST00000480104 C21orf58P58505 322 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 PRAMEP78395 509 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ACVR1Q04771 509 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 BSPH1Q075Z2 132 aa10.64□□□□□ -0.71
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USP11-208ENST00000480104 OCLNQ16625 522 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 DEF8Q6ZN54 512 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.64□□□□□ -0.71
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USP11-208ENST00000480104 OR52K1Q8NGK4 314 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SPNS1Q9H2V7 528 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 DNAJC11Q9NVH1 559 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 MED29Q9NX70 200 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 A0A087X0T9 212 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ESYT3A0FGR9 886 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 URADA6NGE7 173 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 HRKO00198 91 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 IGKV3-11P04433 115 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 FAM228BP0C875 321 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ARFIP2P53365 341 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ID2Q02363 134 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 STX4Q12846 297 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 LRRC38Q5VT99 294 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 IFNEQ86WN2 208 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ABHD11Q8NFV4 315 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 RDH11Q8TC12 318 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ASB11Q8WXH4 323 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 S100PBPQ96BU1 408 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 RHBDF1Q96CC6 855 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 BIRC8Q96P09 236 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 OR2B2Q9GZK3 357 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 RNF122Q9H9V4 155 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SERHLQ9NQF3 203 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 LCMT1Q9UIC8 334 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ANAPC5Q9UJX4 755 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.63□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SHISA9B4DS77 424 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 CYR61O00622 381 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 CTNSO60931 367 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 NDUFS3O75489 264 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ZNF23P17027 643 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SAT1P21673 171 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 CASP3P42574 277 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SCTRP47872 440 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 EFNA4P52798 201 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 GPS1Q13098 491 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 DOC2AQ14183 400 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
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USP11-208ENST00000480104 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 USP43Q70EL4 1123 aa10.62□□□□□ -0.71
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USP11-208ENST00000480104 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 WWOXQ9NZC7 414 aa10.62□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa10.61□□□□□ -0.71
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USP11-208ENST00000480104 H7C417 338 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 LDB3O75112 727 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 AHRP35869 848 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 IRF9Q00978 393 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 FOXL1Q12952 345 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 NFKBIBQ15653 356 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 AAGABQ6PD74 315 aa10.61□□□□□ -0.71
USP11-208ENST00000480104 FAM214BQ7L5A3 538 aa10.61□□□□□ -0.71
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