RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	C21orf59	P57076	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PPARD	Q03181	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CD302	Q8IX05	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	APC	P25054	2843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CIDEA	O60543	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RTN2	O75298	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HMBS	P08397	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	INHBA	P08476	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PRLR	P16471	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ANXA13	P27216	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PSMA5	P28066	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	LHX1	P48742	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NR2C2	P49116	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NUMB	P49757	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SGSH	P51688	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	IL11RA	Q14626	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	VASH2	Q86V25	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080		Q8NFD4	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MTOR	P42345	2549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	URAD	A6NGE7	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GPR137B	O60478	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FYN	P06241	537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC130	P13994	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PTAFR	P25105	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GP5	P40197	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ARSE	P51690	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF131	P52739	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PDX1	P52945	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TUBB4B	P68371	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GTF2B	Q00403	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	KYAT1	Q16773	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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