RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GABRR3A8MPY1 467 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C9JVG2 144 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AKAP10O43572 662 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR10H2O60403 315 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PEX11AO75192 247 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEC22BO75396 215 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR75O95800 540 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGKV3-11P04433 115 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KITP10721 976 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEFHP12036 1026 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CPMP14384 443 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCSK2P16519 638 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRPH2P23942 346 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SERPINB5P36952 375 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NAA20P61599 178 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MGAT2Q10469 447 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STX3Q13277 289 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTGR1Q14914 329 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NNATQ16517 81 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MPEG1Q2M385 716 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACER2Q5QJU3 275 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KAT2AQ92830 837 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TANKQ92844 425 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VMP1Q96GC9 406 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF681Q96N22 645 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGAP4Q96P64 663 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LMF1Q96S06 567 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYNNQ9NPC7 610 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AHSPQ9NZD4 102 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HAO1Q9UJM8 370 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPN13Q12923 2485 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLEQ07864 2286 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1orf226A1L170 272 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WWP2O00308 870 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC28A1O00337 649 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDHDO14521 159 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDH17O14917 1159 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUV39H1O43463 412 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RGS14O43566 566 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC28A2O43868 658 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WISP2O76076 250 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CBX7O95931 251 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FGF4P08620 206 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCKDHAP12694 445 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLA2G2AP14555 144 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNNI3P19429 210 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NT5EP21589 574 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PIK3R1P27986 724 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XKP51811 444 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MLF1P58340 268 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARG2P78540 354 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C2orf80Q0P641 193 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLRB1Q12918 225 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TUBA3CQ13748 450 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SERTAD2Q14140 314 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TERF2Q15554 542 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM64Q6YI46 380 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q6ZS92 163 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms