RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLAMF1Q13291 335 aa16.79■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DIO2Q92813 273 aa16.79■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIB1Q96RU8 372 aa16.79■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.79■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CD274Q9NZQ7 290 aa16.79■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.79■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR10H2O60403 315 aa16.78■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC166P0CW27 439 aa16.78■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 EXT2Q93063 718 aa16.78■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBE2E3Q969T4 207 aa16.78■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 OR4D1Q15615 310 aa16.77■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.77■□□□□ 0.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPR180Q86V85 440 aa16.77■□□□□ 0.28
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UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.76■□□□□ 0.27
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UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.76■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.76■□□□□ 0.27
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CD8B2A6NJW9 211 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR6C76A6NM76 312 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAPN14A8MX76 684 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 GOSR1O95249 250 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 HPNP05981 417 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD1DP15813 335 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 SERPINB1P30740 379 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXW4P57775 412 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP6V0D1P61421 351 aa16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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