RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM22Q9Y584 194 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 POLEQ07864 2286 aa9.51□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 ITGA10O75578 1167 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 SLC25A12O75746 678 aa9.5□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 SLC1A6P48664 564 aa9.5□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 CES4AQ5XG92 561 aa9.5□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 SLC5A8Q8N695 610 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-216ENST00000428482 NME2P22392 152 aa9.49□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.49□□□□□ -0.89
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HDLBP-216ENST00000428482 FAR1Q8WVX9 515 aa9.49□□□□□ -0.89
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