RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 LTB4RQ15722 352 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 HMGN2P46Q86SG4 172 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A8Q8IWU4 369 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SGCDQ92629 289 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 NRBF2Q96F24 287 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CSF3RQ99062 836 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.89■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 AGXTP21549 392 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 MC3RP41968 323 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 BLKP51451 505 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF691Q5VV52 312 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SIX5Q8N196 739 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 EQTNQ9NQ60 294 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 THSD1Q9NS62 852 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 STARD5Q9NSY2 213 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 RHCGQ9UBD6 479 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 AASSQ9UDR5 926 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMDEC1O15204 470 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A6O15403 523 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 HCRTR1O43613 425 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ISL1P61371 349 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 RUNX2Q13950 521 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 OR4N5Q8IXE1 308 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 KAT2AQ92830 837 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF681Q96N22 645 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.88■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0J9YY10 115 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 JRKO75564 520 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 NR2F1P10589 423 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ITGAMP11215 1152 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CPN2P22792 545 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 MPIP34949 423 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 FAHD1Q6P587 224 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 GPR32P1Q8NGA4 272 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 COL26A1Q96A83 441 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 COL21A1Q96P44 957 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF347Q96SE7 839 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 RLIMQ9NVW2 624 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 P2RX2Q9UBL9 471 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.87■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 DPM1O60762 260 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 MFN2O95140 757 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 FESP07332 822 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 XCR1P46094 333 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 IL5RAQ01344 420 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 LAIR2Q6ISS4 152 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM10Q96HG1 83 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 FEVQ99581 238 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SPTBP11277 2137 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 OR5K3A6NET4 321 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CD247P20963 164 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 RXRGP48443 463 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 HLCSP50747 726 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 LIM2P55344 173 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 TNFRSF17Q02223 184 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf90Q96M02 699 aa21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM247A6NEH6 219 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ENO4A6NNW6 628 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 METTL12A8MUP2 240 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 IFNW1P05000 195 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 ITGA2P17301 1181 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CRHBPP24387 322 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CD27P26842 260 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 CD38P28907 300 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT1P36639 197 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 OOSP2Q86WS3 158 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A8Q8N695 610 aa21.85■■□□□ 1.09
FAAP20-209ENST00000428120 GIPC3Q8TF64 312 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms