RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.2□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 CARNS1A5YM72 827 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA0355O15063 1070 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 FKTNO75072 461 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 DIO3P55073 304 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 CD81P60033 236 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP1Q07960 439 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 RSU1Q15404 277 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 FCN2Q15485 313 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 MALSU1Q96EH3 234 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TAF1P21675 1872 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 NPC1O15118 1278 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 CKBP12277 381 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA1024LP59773 190 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 GPR17Q13304 367 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 GRB7Q14451 532 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 DERAQ9Y315 318 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP33O14559 1287 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 HPGDP15428 266 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 MC4RP32245 332 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 AVPR1BP47901 424 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 SLC35A2P78381 396 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM205Q6UW68 189 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 CORO2AQ92828 525 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 FATE1Q969F0 183 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 PKP4Q99569 1192 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 TMEM150BA6NC51 233 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 OR6A2O95222 327 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 SERPINA11Q86U17 422 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TTPALQ9BTX7 342 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 SYT4Q9H2B2 425 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TPST2O60704 377 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TUBG1P23258 451 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 TBX4P57082 545 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 ASB8Q9H765 288 aa6.19□□□□□ -1.42
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SBNO1-202ENST00000420886 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PRQ8 180 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 COMTD1Q86VU5 262 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SBNO1-202ENST00000420886 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.19□□□□□ -1.42
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