RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SOD2P04179 222 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELNP15502 786 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV3P41162 512 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TWF1Q12792 350 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IER5LQ5T953 404 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POC5Q8NA72 575 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP5Q96F15 307 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 REEP4Q9H6H4 257 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SMURF1Q9HCE7 757 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DKK3Q9UBP4 350 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF11BO00300 401 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42EP2O14613 210 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLOD3O60568 738 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BDKRB1P46663 353 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IDH2P48735 452 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAPQ12884 760 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP27C1Q4G0S4 372 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CPTPQ5TA50 214 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 STPG1Q5TH74 334 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COX14Q96I36 57 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBC2A0A5B9 178 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf47O95873 294 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMP2P16035 220 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKEP52429 567 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 INSL4Q14641 139 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPIQ6XZB0 460 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CRELD1Q96HD1 420 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PKP4Q99569 1192 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB18Q99592 522 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBBXA8MT70 800 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM20BO75063 409 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH8O95206 1070 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PAHP00439 452 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PROS1P07225 676 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MYDGFQ969H8 173 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A8Q9BY19 250 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL25Q9H0H3 589 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 STUB1Q9UNE7 303 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 E5RI56 91 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLK4O00444 970 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0355O15063 1070 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CPN2P22792 545 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SDC2P34741 201 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCNKAP51800 687 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIN2CQ14957 1233 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLK5Q496M5 336 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BBS2Q9BXC9 721 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms