RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 PPCDCQ96CD2 204 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 REPS1Q96D71 796 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R16AQ96I34 528 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 SGPP1Q9BX95 441 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 CLEC2DQ9UHP7 191 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 KCND3Q9UK17 655 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 STUB1Q9UNE7 303 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 MEIOCA2RUB1 952 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 HMX3A6NHT5 357 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 RPS5P46782 204 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 PNLIPRP1P54315 467 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 MC1RQ01726 317 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 RUNX1T1Q06455 604 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM52BQ4KMG9 183 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 SLC34A3Q8N130 599 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 WDR34Q96EX3 536 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM80Q96HE8 168 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DEPDC7Q96QD5 511 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 CERS4Q9HA82 394 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 SNTG1Q9NSN8 517 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DYRK1BQ9Y463 629 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DGKEP52429 567 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TBRG1Q3YBR2 411 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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FAAP20-206ENST00000414253 GALNT12Q8IXK2 581 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 A8MV72 311 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 FAM227AF5H4B4 570 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 GUCY1B2O75343 617 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 ADAP00813 363 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 GBAP04062 536 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 RPL3P39023 403 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TAP2Q03519 686 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 NFE2L1Q14494 772 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 NCF4Q15080 339 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM201Q5SNT2 666 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DMRTB1Q96MA1 342 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 MND1Q9BWT6 205 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 NDOR1Q9UHB4 597 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 CMAHPQ9Y471 501 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.28■■□□□ 1.32
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FAAP20-206ENST00000414253 HYKKA2RU49 373 aa23.28■■□□□ 1.32
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FAAP20-206ENST00000414253 ACADLP28330 430 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DMPKQ09013 629 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 OR2L2Q8NH16 312 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 FGF13Q92913 245 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 EFCAB11Q9BUY7 163 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 NDUFB11Q9NX14 153 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 REV1Q9UBZ9 1251 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 GPR34Q9UPC5 381 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 ANTXRLA6NF34 631 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 C2orf80Q0P641 193 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DUSP7Q16829 419 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 FAM92BQ6ZTR7 304 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 ARMCX6Q7L4S7 300 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 SLC30A8Q8IWU4 369 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 UCK2Q9BZX2 261 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DPEP2Q9H4A9 486 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 TIGARQ9NQ88 270 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa23.27■■□□□ 1.32
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FAAP20-206ENST00000414253 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
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FAAP20-206ENST00000414253 RACK1P63244 317 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 SCN1BQ07699 218 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 ILKQ13418 452 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 GPM6BQ13491 265 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 C16orf78Q8WTQ4 265 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa23.27■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 PIPSLA2A3N6 862 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 VEGFDO43915 354 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 LIM2P55344 173 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 SLAMF1Q13291 335 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 FAM71E1Q6IPT2 247 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-206ENST00000414253 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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