RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WASH3PC4AMC7 463 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 M0QX08 132 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF197O14709 1029 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITM2AO43736 263 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EXTL3O43909 919 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GMNNO75496 209 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLN5O75503 358 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCAR3O75815 825 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEBLO76041 1014 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFA7O95182 113 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HPRP00739 348 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UGT2B4P06133 528 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GP9P14770 177 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANPEPP15144 967 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CPN1P15169 458 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYOD1P15172 320 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPD1P21695 349 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AXLP30530 894 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKAR2BP31323 418 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPHX2P34913 555 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RFC2P35250 354 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPS15P42566 896 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCR4P51679 360 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THOP1P52888 689 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CBX1P83916 185 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDE1BQ01064 536 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NAAAQ02083 359 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLC1Q07866 573 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTX1Q13505 466 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF234Q14588 700 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIP10Q15642 601 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HLFQ16534 295 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR33Q49SQ1 333 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC01620Q4KN68 170 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCL7AQ4VC05 210 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAF3Q5VWG9 929 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PMF1Q6P1K2 205 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIP4P1Q86T03 277 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCLK2Q8N568 766 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMYD1Q8NB12 490 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHYHIPQ92561 330 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEX13Q92968 403 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COQ2Q96H96 371 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PELI2Q9HAT8 420 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HPS4Q9NQG7 708 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LHX3Q9UBR4 397 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RIPK3Q9Y572 518 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL4A5P29400 1685 aa3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABCC12Q96J65 1359 aa3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A0G2JNG1 304 aa3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1W2PN81 502 aa3.44□□□□□ -1.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 hDV102S1A0JD36 115 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms