RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KDM1BQ8NB78 822 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF382Q96SR6 550 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FEVQ99581 238 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RGCCQ9H4X1 137 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BRF2Q9HAW0 419 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KLF15Q9UIH9 416 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NUMA1Q14980 2115 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 VILLO15195 856 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CA12O43570 354 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CD1DP15813 335 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CARD16Q5EG05 197 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TPGS2Q68CL5 300 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DESI1Q6ICB0 168 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LCN8Q6JVE9 175 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF550Q7Z398 422 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR8K3Q8NH51 312 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ELP5Q8TE02 316 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP90Q8TF47 636 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf74Q96LT6 269 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TP53I11O14683 189 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CAPN3P20807 821 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OXTRP30559 389 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SOX2P48431 317 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF84P51523 738 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ACTC1P68032 377 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ACTA1P68133 377 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PDGFRLQ15198 375 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 OR8S1Q8NH09 359 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NDNFQ8TB73 568 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NUS1Q96E22 293 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CD244Q9BZW8 370 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KCNH6Q9H252 994 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GPR32O75388 356 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ATE1O95260 518 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PTTG1O95997 202 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MT-CO2P00403 227 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TNFP01375 233 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CD3GP09693 182 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HSD17B1P14061 328 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TUBG1P23258 451 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BDKRB1P46663 353 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FXYD6P3P58550 94 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SH3BP2P78314 561 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BDH1Q02338 343 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KCNC4Q03721 635 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 THEM6Q8WUY1 208 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LDAHQ9H6V9 325 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM100Q9NV29 134 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GNG8Q9UK08 70 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GUL6 1792 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GRID2O43424 1007 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 IQCF3P0C7M6 154 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.5□□□□□ -1.05
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