RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 A8MUI8 341 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MPIP34949 423 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SOX18P35713 384 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SOX11P35716 441 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LAPTM4BQ86VI4 370 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZNF595Q8IYB9 648 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PRSS58Q8IYP2 241 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SLC35A5Q9BS91 424 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 L3MBTL1Q9Y468 752 aa21.85■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CTNSO60931 367 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PORP16435 677 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SOAT1P35610 550 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 LIPEQ05469 1076 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NETO1Q8TDF5 533 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 KAT2AQ92830 837 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PISDQ9UG56 409 aa21.84■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MS4A2Q01362 244 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TMEM107Q6UX40 140 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 IFNEQ86WN2 208 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SIMC1Q8NDZ2 872 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 OR10A6Q8NH74 314 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MAGED4Q96JG8 741 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ULBP3Q9BZM4 244 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 NECTIN3Q9NQS3 549 aa21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FAM149AA5PLN7 773 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MEN1O00255 615 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 PPP2R1BP30154 601 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GSK3BP49841 420 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MVDP53602 400 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DCDP81605 110 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ZNF583Q96ND8 569 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NEUROD4Q9HD90 331 aa21.83■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CLDN4O14493 209 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 PLD2O14939 933 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NME6O75414 186 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 HBQ1P09105 142 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GPC1P35052 558 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 COX20Q5RI15 118 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP24Q8N264 748 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 OR1F2PQ96R84 312 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GFRA3O60609 400 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 JMJD7P0C870 316 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CDK4P11802 303 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 UQCRC2P22695 453 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ME2P23368 584 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MC3RP41968 323 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ERFP50548 548 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 HSD17B7P56937 341 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ELP4Q96EB1 424 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ECSITQ9BQ95 431 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 ALG2Q9H553 416 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 POMPQ9Y244 141 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CCDC187A0A096LP49 1063 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CEACAM1P13688 526 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 GZMMP51124 257 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 STX4Q12846 297 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 FAM111BQ6SJ93 734 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.81■■□□□ 1.08
CNN3-202ENST00000394202 MED25Q71SY5 747 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms