RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391309.1

SNORD30.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 30, humanhuman

BASIC

Gene SNORD30, Length 70 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGHV3-9P01782 118 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PSMC3P17980 439 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PTPN4P29074 926 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 RAB27AP51159 221 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 F2RL1P55085 397 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 EVCP57679 992 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 BTG1P62324 171 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 BCL2L1Q07817 233 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 C17orf67Q0P5P2 114 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZNF154Q13106 437 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CUL4BQ13620 913 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PARP10Q53GL7 1025 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 RAET1GQ6H3X3 334 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 NEPROQ6NW34 567 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TMEM110Q86TL2 294 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 OR2C3Q8N628 320 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 LRTM2Q8N967 370 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 Q8N976 141 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 OR4K1Q8NGD4 311 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 LIPHQ8WWY8 451 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 NEIL2Q969S2 332 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CDHR1Q96JP9 859 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 RNF157Q96PX1 679 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 FNDC11Q9BVV2 318 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TNMDQ9H2S6 317 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 DPEP2Q9H4A9 486 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 DCTPP1Q9H773 170 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 Q9H8V8 135 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PLAC8Q9NZF1 115 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 EHD2Q9NZN4 543 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CD274Q9NZQ7 290 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 NRBP1Q9UHY1 535 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 WDR83OSQ9Y284 106 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TMED3Q9Y3Q3 217 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 THSD7BQ9C0I4 1608 aa-1.66□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PI4KAP2A4QPH2 592 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 YDJCA8MPS7 323 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 G3V3Y1 287 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 LAD1O00515 517 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ZNF263O14978 683 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 AHCYL1O43865 530 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 VAMP5O95183 116 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CSF2P04141 144 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ACTN1P12814 892 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CETN2P41208 172 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 SLC9A3P48764 834 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ACTR2P61160 394 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 SMARCB1Q12824 385 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 DPYSL3Q14195 570 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PFKFB4Q16877 469 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 WDR45BQ5MNZ6 344 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ANKRD45Q5TZF3 282 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CYB5D1Q6P9G0 228 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 Q71RC1 249 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 SRLQ86TD4 932 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TEX26Q8N6G2 289 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TMEM41AQ96HV5 264 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PSMD1Q99460 953 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 SPC25Q9HBM1 224 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ONECUT1Q9UBC0 465 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 RNF115Q9Y4L5 304 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 HSPG2P98160 4391 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TMEM221A6NGB7 291 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 H0YL77 283 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CCL24O00175 119 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 USO1O60763 962 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 GUCY1B2O75343 617 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 AIFM1O95831 613 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 KRT18P05783 430 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 OR2T7P0C7T2 308 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CD59P13987 128 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CBR1P16152 277 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 TCN2P20062 427 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 CD27P26842 260 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PPP2R1AP30153 589 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 MFAP2P55001 183 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ACSM1Q08AH1 577 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 PRDX4Q13162 271 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 ANKRD1Q15327 319 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD30.1-201ENST00000391309 DEFB115Q30KQ5 88 aa-1.68□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms