RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa9.53□□□□□ -0.88
CLRN3-201ENST00000368671 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 FAM159BA6NKW6 160 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 K7EPI3 171 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 OR10H2O60403 315 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SCELO95171 688 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 IGKV3-11P04433 115 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GABRA1P14867 456 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SERPINB1P30740 379 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CASP2P42575 452 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 DLG1Q12959 904 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 E2F2Q14209 437 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GRTP1Q5TC63 336 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ARSKQ6UWY0 536 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GPR180Q86V85 440 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 LIX1Q8N485 282 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SLC15A4Q8N697 577 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 TEX9Q8N6V9 391 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PPM1NQ8N819 430 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 RGMAQ96B86 450 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 FBXL20Q96IG2 436 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CENPKQ9BS16 269 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PHF11Q9UIL8 331 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.52□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GLOD5A6NK44 160 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PLPP1O14494 284 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 KERAO60938 352 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CD99P14209 185 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 EPB42P16452 691 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GDF1P27539 372 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 UQCRC1P31930 480 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 KIR2DL3P43628 341 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 WNT3P56703 355 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GPX6P59796 221 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ISCA2Q86U28 154 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 TANKQ92844 425 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 NXNL1Q96CM4 212 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 DOHHQ9BU89 302 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 LIME1Q9H400 295 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PROK2Q9HC23 129 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CNIH4Q9P003 139 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 WHRNQ9P202 907 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 MED13LQ71F56 2210 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 HSPB2A8KAH6 182 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 PROM1O43490 865 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 CTAG2O75638 210 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 C1QAP02745 245 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 GSTA2P09210 222 aa9.5□□□□□ -0.89
CLRN3-201ENST00000368671 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms