RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MEI4A8MW99 385 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 OGTO15294 1046 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CREB3O43889 395 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PLIN3O60664 434 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TOM1L1O75674 476 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 STAM2O75886 525 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 OR6B1O95007 311 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ASNSP08243 561 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 COX4I1P13073 169 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CD1EP15812 388 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TPSB2P20231 275 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CYP3A5P20815 502 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PRDX6P30041 224 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FDFT1P37268 417 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SLC1A6P48664 564 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NUMBP49757 651 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ERFP50548 548 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 AQP4P55087 323 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CDH6P55285 790 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CDH8P55286 799 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SP3Q02447 781 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CREB5Q02930 508 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FOLH1Q04609 750 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MED21Q13503 144 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PEX6Q13608 980 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RAPSNQ13702 412 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TFDP2Q14188 446 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PDK3Q15120 406 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TPSAB1Q15661 275 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CA9Q16790 459 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 WDR78Q5VTH9 848 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ARMC3Q5W041 872 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TSSK4Q6SA08 328 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 C4orf22Q6V702 233 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZR54 194 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF534Q76KX8 674 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ARCQ7LC44 396 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KBTBD6Q86V97 674 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LSMEM2Q8N112 164 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RXFP2Q8WXD0 754 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 USP6NLQ92738 828 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ITFG2Q969R8 447 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 OPTNQ96CV9 577 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC39Q96DD0 335 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MAGED4Q96JG8 741 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FAM210AQ96ND0 272 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SORT1Q99523 831 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CNPY3Q9BT09 278 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CALN1Q9BXU9 219 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MIS12Q9H081 205 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 P2RY12Q9H244 342 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PELI2Q9HAT8 420 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TMCO1Q9UM00 188 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 POMPQ9Y244 141 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LCTP09848 1927 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms