RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 MTERF3Q96E29 417 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NELL2Q99435 816 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GPA33Q99795 319 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SEMA3GQ9NS98 782 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SSR3Q9UNL2 185 aa17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 HMX3A6NHT5 357 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ANHXE9PGG2 379 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 M0R3H8 397 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RFXAPO00287 272 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 HMGN4O00479 90 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PLPP1O14494 284 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MYL12BO14950 172 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SOD1P00441 154 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CA8P35219 290 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 WDR5P61964 334 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RUNX1T1Q06455 604 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR2G6Q5TZ20 316 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 UNC5DQ6UXZ4 953 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LIPIQ6XZB0 460 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 USP30Q70CQ3 517 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SLC9B2Q86UD5 537 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR9A1PQ8NGU1 263 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CAPNS2Q96L46 248 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DEPDC7Q96QD5 511 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LINC00597Q9H2U6 94 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ICKQ9UPZ9 632 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 B4DXG7 233 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TGM5O43548 720 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 INHAP05111 366 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CAV3P56539 151 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RPS25P62851 125 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ASAH1Q13510 395 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SYT14P1Q58G82 188 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DPPA4Q7L190 304 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TRIM69Q86WT6 500 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SLC7A6Q92536 515 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TM9SF4Q92544 642 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MSLNLQ96KJ4 702 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF558Q96NG5 402 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR2AG1Q9H205 316 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 HCN2Q9UL51 889 aa17.82■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ELFN1P0C7U0 828 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SDC2P34741 201 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MMP12P39900 470 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ACSM5Q6NUN0 579 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PODNL1Q6PEZ8 512 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 A4GNTQ9UNA3 340 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PLA2G10O15496 165 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TYRP14679 529 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CD79BP40259 229 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GSTM5P46439 218 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 KCNJ5P48544 419 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GAS1P54826 345 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SCN1BQ07699 218 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SYPL1Q16563 259 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OCLNQ16625 522 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DEFB115Q30KQ5 88 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SNAP47Q5SQN1 464 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 IKBIPQ70UQ0 350 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 C6orf120Q7Z4R8 191 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SLC30A8Q8IWU4 369 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SLC22A4Q9H015 551 aa17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TSPAN11A1L157 253 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DDCP20711 480 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MMP11P24347 488 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 KIR2DL3P43628 341 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TRIM48Q8IWZ4 208 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FGF11Q92914 225 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LRR1Q96L50 414 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 F2RL3Q96RI0 385 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RACGAP1Q9H0H5 632 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FABP12A6NFH5 140 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CXCL10P02778 98 aa17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms