RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 INPP1P49441 399 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PLAG1Q6DJT9 500 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TANGO2Q6ICL3 276 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TRIM69Q86WT6 500 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 RDH10Q8IZV5 341 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 DOHHQ9BU89 302 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 LGR4Q9BXB1 951 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 RHCGQ9UBD6 479 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 NLKQ9UBE8 527 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SSR3Q9UNL2 185 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SPINT1O43278 529 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ATG13O75143 517 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CBSLP0DN79 551 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 AMD1P17707 334 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 GPX2P18283 190 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 IMPA1P29218 277 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CNR2P34972 360 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CBSP35520 551 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MMP12P39900 470 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CRATP43155 626 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZNF234Q14588 700 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ESCO2Q56NI9 601 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 C9orf64Q5T6V5 341 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 FAM9CQ8IZT9 166 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TAGAPQ8N103 731 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MMP21Q8N119 569 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TESCQ96BS2 214 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CHFRQ96EP1 664 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 FAM129BQ96TA1 746 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SPNS1Q9H2V7 528 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ASIC5Q9NY37 505 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ALPK3Q96L96 1907 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 I3L521 148 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 BTN3A3O00478 584 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PLD2O14939 933 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SLCO2B1O94956 709 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ALPPP05187 535 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 C6P13671 934 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 GABRB1P18505 474 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PTGS2P35354 604 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CRYBA2P53672 197 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ACSM2AQ08AH3 577 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 GPM6BQ13491 265 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SPHARQ15513 63 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 DDI2Q5TDH0 399 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ACSM2BQ68CK6 577 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 C22orf42Q6IC83 251 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZNF767PQ75MW2 155 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TIGD4Q8IY51 512 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZNF480Q8WV37 535 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PHF21AQ96BD5 680 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SLC6A17Q9H1V8 727 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 DIABLOQ9NR28 239 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MAFFQ9ULX9 164 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 KIAA1671Q9BY89 1806 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 FAM227AF5H4B4 570 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PCDH17O14917 1159 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 TSPAN9O75954 239 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PCDH8O95206 1070 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SOX14O95416 240 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SOD1P00441 154 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 SCG5P05408 212 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZNF30P17039 623 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MAP2K3P46734 347 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 UGT8Q16880 541 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 MICAQ29983 383 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 WSCD2Q2TBF2 565 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 FAM205BPQ63HN1 556 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 XKRXQ6PP77 449 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC27-201ENST00000317907 ZNF547Q8IVP9 402 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms