RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 DGAT2Q96PD7 388 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 NPAS2Q99743 824 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.48□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SPTA1P02549 2419 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 BLACEA4D250 179 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PCDH17O14917 1159 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD28O15084 1053 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 OR10H2O60403 315 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CEACAM4O75871 244 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35E2P0CK97 266 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 LBPP18428 481 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 NME5P56597 212 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PLIN5Q00G26 463 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 COLEC12Q5KU26 742 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ELP5Q8TE02 316 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 NCLNQ969V3 563 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 REEP4Q9H6H4 257 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 KCNK13Q9HB14 408 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 NPHS2Q9NP85 383 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 GPR83Q9NYM4 423 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 F10P00742 488 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CLPSP04118 112 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINA7P05543 415 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CD1EP15812 388 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 SSTR4P31391 388 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 OGFOD2Q6N063 350 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF721Q8TF20 911 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 KAT2AQ92830 837 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 RIT1Q92963 219 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 LHPPQ9H008 270 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 EHD3Q9NZN3 535 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.47□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.46□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 E9PBE3 544 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL41O60662 606 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV3-11P04433 115 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ATP1B1P05026 303 aa8.46□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 LAMP1P11279 417 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PRPS2P11908 318 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 S1PR1P21453 382 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 MAPK1P28482 360 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 IL12AP29459 219 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SEC24CP53992 1094 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 UFM1P61960 85 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 DUSP8Q13202 625 aa8.46□□□□□ -1.05
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