RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 RIT1Q92963 219 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PPCDCQ96CD2 204 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 BBS4Q96RK4 519 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 EBF4Q9BQW3 602 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 LHPPQ9H008 270 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 FAM87AP0C7U9 286 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ITGAMP11215 1152 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PTGER1P34995 402 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 AP2B1P63010 937 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP2Q05923 314 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 MORN4Q8NDC4 146 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 NCLNQ969V3 563 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF681Q96N22 645 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK13Q9HB14 408 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 MMP25Q9NPA2 562 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 GPR83Q9NYM4 423 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 GABRR3A8MPY1 467 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PRPS1L1P21108 318 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SOX8P57073 446 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 MYBPC3Q14896 1274 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM198Q66K66 360 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SIRT6Q8N6T7 355 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 MTERF3Q96E29 417 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 VMP1Q96GC9 406 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 MARK4Q96L34 752 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DPY30Q9C005 99 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 AIG1Q9NVV5 245 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 A8MUI8 341 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ATP1B1P05026 303 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 NTSP30990 170 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 GALNSP34059 522 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 MPIP34949 423 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 NME5P56597 212 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN8P56748 225 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 PDE7AQ13946 482 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF385BQ569K4 471 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT8Q8WV74 236 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0G2JND7 137 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 E9PBE3 544 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 HRKO00198 91 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 UBDO15205 165 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL41O60662 606 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 CEACAM4O75871 244 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 DDAH2O95865 285 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 CLCN2P51788 898 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 GPR143P51810 404 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 KCNAB2Q13303 367 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 RPS6KA2Q15349 733 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 LTB4RQ15722 352 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ELP5Q8TE02 316 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ART5Q96L15 291 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT9Q9BW91 350 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD4-201ENST00000306324 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms