RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 TMEM35AQ53FP2 167 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 PTCHD4Q6ZW05 846 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 ZNF554Q86TJ5 538 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 OR8K5Q8NH50 307 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 SLC17A9Q9BYT1 436 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa18.21■□□□□ 0.51
USP21-201ENST00000289865 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ADAP00813 363 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PTHP01270 115 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 NTSP30990 170 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ZIC1Q15915 447 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 DCST1Q5T197 706 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PARM1Q6UWI2 310 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 LINC00299Q6ZSB3 139 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 LACC1Q8IV20 430 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 BBS4Q96RK4 519 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 DCSTAMPQ9H295 470 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 C11orf16Q9NQ32 467 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 H1F0P07305 194 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 NR2F1P10589 423 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 BMP4P12644 408 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PBX2P40425 430 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 HYAL2Q12891 473 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SLAMF1Q13291 335 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SLC9A5Q14940 896 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 OLIG3Q7RTU3 272 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 FBXL6Q8N531 539 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 FGF14Q92915 247 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MS4A6EQ96DS6 147 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 UCK2Q9BZX2 261 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 RMI1Q9H9A7 625 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 KCNK12Q9HB15 430 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 EHD3Q9NZN3 535 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MYO9BQ13459 2157 aa18.2■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MAN2B1O00754 1011 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 OR10H3O60404 316 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SERPINB7O75635 380 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SOX14O95416 240 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ALPPL2P10696 532 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PRKAG1P54619 331 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 INAQ16352 499 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 UAP1L1Q3KQV9 507 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MFSD4AQ8N468 514 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 DHRS1Q96LJ7 313 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MVB12BQ9H7P6 319 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 CLN6Q9NWW5 311 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 SPHK1Q9NYA1 384 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 UNC80Q8N2C7 3258 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.19■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PRR19A6NJB7 356 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 K7EQS6 105 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 FAAHO00519 579 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PGRMC2O15173 223 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 LINC01565O15544 149 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 IRF3Q14653 427 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 GPR19Q15760 415 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 RPE65Q16518 533 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ZNF750Q32MQ0 723 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 COMTD1Q86VU5 262 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 TMEM145Q8NBT3 493 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 OR2L3Q8NG85 312 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 YIPF4Q9BSR8 244 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 APOOQ9BUR5 198 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 ZSCAN32Q9NX65 697 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 REV1Q9UBZ9 1251 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 M0R3H8 397 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 MPZL2O60487 215 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 OSMP13725 252 aa18.18■□□□□ 0.5
USP21-201ENST00000289865 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms