RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ASB6Q9NWX5 421 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM69Q5SWH9 247 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PHC2Q8IXK0 858 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CASTOR1Q8WTX7 329 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MAFFQ9ULX9 164 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CYP17A1P05093 508 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SRCP12931 536 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 STT3AP46977 705 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CD97P48960 835 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SPARCP09486 303 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GMPRP36959 345 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PPP5CP53041 499 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 APOL3O95236 402 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 VNN2O95498 520 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SPINT3P49223 89 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MAN2A2P49641 1150 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 POLE4Q9NR33 117 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 BPIP17213 487 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RAB30Q15771 203 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CDKL4Q5MAI5 379 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PHF19Q5T6S3 580 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 DPH7Q9BTV6 452 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 A8MU76 341 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 H3BSH0 61 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB134Q4QY38 66 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR8K3Q8NH51 312 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NELL2Q99435 816 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ABCG5Q9H222 651 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 MYNNQ9NPC7 610 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH17O14917 1159 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 HCRTR2O43614 444 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2F2P13984 249 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN3P20807 821 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 M0R036 132 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PTNP21246 168 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PLGLB1Q02325 96 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf78A6NCI8 922 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ANHXE9PGG2 379 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 IL7P13232 177 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA6P43360 314 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 HTR6P50406 440 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD6P3P58550 94 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GPR150Q8NGU9 434 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ETFAP13804 333 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DPP6P42658 865 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SGTBQ96EQ0 304 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 HYKKA2RU49 373 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 ELOCQ15369 112 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR8S1Q8NH09 359 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 IL17FQ96PD4 163 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 GSKIPQ9P0R6 139 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 PTGESO14684 152 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 WNT7BP56706 349 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 NFE2L1Q14494 772 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms