RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SPON2Q9BUD6 331 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RAD18Q9NS91 495 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TMEM82A0PJX8 343 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DHFRP00374 187 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 NMBP08949 121 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C4BPBP20851 252 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RGRP47804 291 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF235Q14590 738 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HFEQ30201 348 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GPR153Q6NV75 609 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 OR1M1Q8NGA1 313 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF599Q96NL3 588 aa20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CDRT1O95170 752 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GABRB1P18505 474 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CDH4P55283 916 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PTPRCAPQ14761 206 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PAQR7Q86WK9 346 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TCEAL3Q969E4 200 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PLD4Q96BZ4 506 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MAGEH1Q9H213 219 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 EQTNQ9NQ60 294 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ISM1B1AKI9 464 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HTR3BO95264 441 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LPLP06858 475 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PAMP19021 973 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 RAB33AQ14088 237 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PTPRRQ15256 657 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.85■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SZT2Q5T011 3432 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 OR51F1A6NGY5 319 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PRRG1O14668 218 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LDB2O43679 373 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 APOC3P02656 99 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HRGP04196 525 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CA3P07451 260 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PIRTP0C851 137 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLC6A1P30531 599 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CTNNB1P35222 781 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 NNMTP40261 264 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PBX2P40425 430 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 INPP1P49441 399 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 PPP3R1P63098 170 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZXDBP98169 803 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C3P1Q6ZMU1 363 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 STX12Q86Y82 276 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 OR2T11Q8NH01 316 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GAREM1Q9H706 876 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 C1orf109Q9NX04 203 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 LINC01553A4QN01 128 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HBQ1P09105 142 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SDC2P34741 201 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HNMTP50135 292 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 EPHA4P54764 986 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 DOC2BQ14184 412 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 FGL2Q14314 439 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ATG9BQ674R7 924 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SSR3Q9UNL2 185 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SLC22A7Q9Y694 548 aa20.84■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MYO9BQ13459 2157 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GTL3 188 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 URODP06132 367 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms