RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 IL1AP01583 271 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CHMP24386 653 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WNT3P56703 355 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RAB40BQ12829 278 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LHX8Q68G74 356 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PHF21AQ96BD5 680 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRRC1Q96M27 445 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SGPP1Q9BX95 441 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM165Q9HC07 324 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ASB4Q9Y574 426 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HCN1O60741 890 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SYN1P17600 705 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF1BP20333 461 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CPN2P22792 545 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LIPAP38571 399 aa8.41□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CEP78Q5JTW2 689 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 COL26A1Q96A83 441 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WDR34Q96EX3 536 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FRMD6Q96NE9 622 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NEK6Q9HC98 313 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 EQTNQ9NQ60 294 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GW55 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 H7BY64 318 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRKYO43930 277 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF21O75509 655 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SOX30O94993 753 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LAMP2P13473 410 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NPPBP16860 134 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PDHA2P29803 388 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MC1RQ01726 317 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCDH1Q08174 1060 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GAB1Q13480 694 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LRRC32Q14392 662 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OCLNQ16625 522 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LCN9Q8WX39 176 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RAD9AQ99638 391 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KLHL1Q9NR64 748 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DUX4Q9UBX2 424 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AASSQ9UDR5 926 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CA5AP35218 305 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RAB14P61106 215 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 REEP5Q00765 189 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADAM15Q13444 863 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NFE2L1Q14494 772 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SAXO2Q658L1 398 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TBX19O60806 448 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GASTP01350 101 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CKMT1AP12532 417 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 F8A1P23610 371 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WNT4P56705 351 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC13A2Q13183 592 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CARTPTQ16568 116 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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