RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C17orf64Q86WR6 236 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DPH7Q9BTV6 452 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SGPP1Q9BX95 441 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NUAK2Q9H093 628 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MMP28Q9H239 520 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BRF2Q9HAW0 419 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.22□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ALPK3Q96L96 1907 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GSAPA4D1B5 854 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FAM183AA6NL82 134 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TLR4O00206 839 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SLC2A10O95528 541 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 EML2O95834 649 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SERPINB1P30740 379 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SSR2P43308 183 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.099e-13■■□□□ 11.4
GINS1-201ENST00000262460 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCNJQ5T5M9 372 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C22orf42Q6IC83 251 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 REEP3Q6NUK4 255 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 VRK2Q86Y07 508 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GHDCQ8N2G8 530 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FBXL6Q8N531 539 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MYDGFQ969H8 173 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NACC2Q96BF6 587 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ABHD8Q96I13 439 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TBX5Q99593 518 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RHBGQ9H310 441 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DYRK4Q9NR20 520 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.21□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SEC16AO15027 2179 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SNPHO15079 494 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PDPK1O15530 556 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 HRO43593 1189 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FCMRO60667 390 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 UPK1BO75841 260 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 AP2A2O94973 939 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 EPPINO95925 133 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TIMP1P01033 207 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CBLP22681 906 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CERS1P27544 350 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 BSGP35613 385 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FGL2Q14314 439 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KRT33BQ14525 404 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 BCL7AQ4VC05 210 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GPAT3Q53EU6 434 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SLC9A6Q92581 669 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 VMP1Q96GC9 406 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 OPALINQ96PE5 141 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 DEC1Q9P2X7 70 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0355O15063 1070 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KMOO15229 486 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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