RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 E2F3O00716 465 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SCDO00767 359 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 KIAA0513O60268 411 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RAD1O60671 282 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LDB3O75112 727 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 UBXN7O94888 489 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 UQCRC2P22695 453 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ARRB2P32121 409 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 IRS1P35568 1242 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PIK3CBP42338 1070 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HLCSP50747 726 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CRISP1P54107 249 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TUBA4AP68366 448 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 BNC1Q01954 994 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RBBP4Q09028 425 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SEMA3BQ13214 749 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CLCA4Q14CN2 919 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TRAM2Q15035 370 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 KLBQ86Z14 1044 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GJD3Q8N144 294 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TMEM156Q8N614 296 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PDPRQ8NCN5 879 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GTF2H4Q92759 462 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 UBE2FQ969M7 185 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 WDR92Q96MX6 357 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RDH14Q9HBH5 336 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TAS2R7Q9NYW3 318 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LHX3Q9UBR4 397 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ASB1Q9Y576 335 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GTW7 788 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 IRGMA1A4Y4 181 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ANTXRLA6NF34 631 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 J3KTA2 159 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CCRL2O00421 344 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SEMA3DO95025 777 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RCBTB2O95199 551 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GSRP00390 522 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OPN1LWP04000 364 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CAPNS1P04632 268 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TFAP2AP05549 437 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 FHP07954 510 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GKN3PP0CG01 181 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 BMP2P12643 396 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ZNF3P17036 446 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HK1P19367 917 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GADD45AP24522 165 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CERS1P27544 350 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 NTSR1P30989 418 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MC3RP41968 323 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MAGEA3P43357 314 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RAB28P51157 221 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HBA1P69905 142 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ADAM8P78325 824 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ARFRP1Q13795 201 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ERV3-1Q14264 604 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RGNQ15493 299 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MOGQ16653 247 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 EIPR1Q53HC9 387 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 BICRALQ6AI39 1079 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ASPGQ86U10 573 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ANKFN1Q8N957 763 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR2T11Q8NH01 316 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PIP5K1AQ99755 562 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PRR14Q9BWN1 585 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms