RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.73■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SEC22BO75396 215 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CHEK2O96017 543 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G2AP14555 144 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CD96P40200 585 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MLLT10P55197 1068 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ARG2P78540 354 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TLE1Q04724 770 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MGAT2Q10469 447 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TUBA3CQ13748 450 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HOMEZQ8IX15 550 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 EGLN2Q96KS0 407 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 NBASA2RRP1 2371 aa20.72■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DYTNA2CJ06 578 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 OR5H15A6NDH6 313 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GABRR3A8MPY1 467 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZFAND5O76080 213 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HSPA4LO95757 839 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 NEFHP12036 1026 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 COX7A2P14406 83 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 S1PR1P21453 382 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 GSTM5P46439 218 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ALDH9A1P49189 494 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 STX3Q13277 289 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TLR1Q15399 786 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 NR6A1Q15406 480 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DDIASQ8IXT1 998 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 OR8K3Q8NH51 312 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RIT1Q92963 219 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 FBXL20Q96IG2 436 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MYNNQ9NPC7 610 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.71■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 OR10H2O60403 315 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-8P63133 956 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 RNF4P78317 190 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 C2orf80Q0P641 193 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 FUT7Q11130 342 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CEBPEQ15744 281 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HSDL2Q6YN16 418 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 C9orf40Q8IXQ3 194 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 MDS2Q8NDY4 140 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.7■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ATP6AP2O75787 350 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ATP1B1P05026 303 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 UQCRHP07919 91 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SDC1P18827 310 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 DDCP20711 480 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PTGER1P34995 402 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 HK2P52789 917 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SLC37A1P57057 533 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 KLHL29Q96CT2 875 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 C19orf60Q96EN9 201 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PNPOQ9NVS9 261 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 EHD3Q9NZN3 535 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 MYOTQ9UBF9 498 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ZNF639Q9UID6 485 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 PSME2Q9UL46 239 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 TTLL8A6PVC2 850 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 ITGA10O75578 1167 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 NEURL1O76050 574 aa20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SYF2-201ENST00000236273 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms