RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 PDE7AQ13946 482 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NSDHLQ15738 373 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 AGKQ53H12 422 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF385BQ569K4 471 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CPTPQ5TA50 214 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MED25Q71SY5 747 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 STARD8Q92502 1023 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GATA6Q92908 595 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP26Q9BV47 211 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CLMPQ9H6B4 373 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SAR1AQ9NR31 198 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 EHD3Q9NZN3 535 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ARMCX1Q9P291 453 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IL17BQ9UHF5 180 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KCND3Q9UK17 655 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FAM234BA2RU67 622 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NR5A2O00482 541 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PDPK1O15530 556 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TBX19O60806 448 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RECKO95980 971 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IGHEP01854 428 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA16P05015 189 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IL6P05231 212 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 UMODP07911 640 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CPMP14384 443 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NTSP30990 170 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OTX2P32243 289 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 S100A3P33764 101 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KIR3DL1P43629 444 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 XKP51811 444 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DGKQP52824 942 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KCNK10P57789 538 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KLF10Q13118 480 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GK5Q6ZS86 529 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TESCQ96BS2 214 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf44Q96CB5 159 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DGAT2Q96PD7 388 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 BBS4Q96RK4 519 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MRGBPQ9NV56 204 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SPTBN2O15020 2390 aa7.98□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CACNA1AO00555 2505 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SEC16AO15027 2179 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FRYQ5TBA9 3013 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC154A6NI56 674 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 A8MUA0 341 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RNF223E7ERA6 249 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KLK10O43240 276 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR10H2O60403 315 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms