RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 RAP1GDS1P52306 607 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PLIN5Q00G26 463 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SLAMF1Q13291 335 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 BIKQ13323 160 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MPEG1Q2M385 716 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 REPS1Q96D71 796 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SGCZQ96LD1 299 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ACTR8Q9H981 624 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ABCA2Q9BZC7 2435 aa20.38■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 A0A0A6YYD5 115 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ACOT7O00154 380 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ZWINTO95229 277 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TNNI3P19429 210 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PHBP35232 272 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 IST1P53990 364 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PHEXP78562 749 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 FOLH1Q04609 750 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CUL3Q13618 768 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 GTF2H2Q13888 395 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 KLC3Q6P597 504 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 OPN5Q6U736 354 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 GK5Q6ZS86 529 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 GPR180Q86V85 440 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 C9orf40Q8IXQ3 194 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TANKQ92844 425 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 FBXL20Q96IG2 436 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ART5Q96L15 291 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 DGAT2Q96PD7 388 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TTTY12Q9BZ98 90 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TYK2P29597 1187 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 BSGP35613 385 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PPP2R2AP63151 447 aa20.36■□□□□ 0.85
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SRRT-218ENST00000620394 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 C18orf63Q68DL7 685 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 UCK2Q9BZX2 261 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 HRH3Q9Y5N1 445 aa20.36■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PROM1O43490 865 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 IGHG3P01860 377 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CNR1P21554 472 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PPIAP62937 165 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ACAD11Q709F0 780 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MMP21Q8N119 569 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 IPPKQ9H8X2 491 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ASB4Q9Y574 426 aa20.35■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 DYRK3O43781 588 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TMPRSS11DO60235 418 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SEMA3DO95025 777 aa20.34■□□□□ 0.85
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