RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 CRISP3P54108 245 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RHAGQ02094 409 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CAMK1Q14012 370 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SEC23BQ15437 767 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MED22Q15528 200 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ATCAYQ86WG3 371 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SUSD6Q92537 303 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RAB8BQ92930 207 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CFL2Q9Y281 166 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ATP6V1G1O75348 118 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLITRK5O94991 958 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SOX6P35712 828 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ETV6P41212 452 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 C12orf73Q69YU5 71 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FEZF1A0PJY2 475 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ANHXE9PGG2 379 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 KMOO15229 486 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 AQP9O43315 295 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OR10H3O60404 316 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ADRA2AP08913 450 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 GPR89BP0CG08 455 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PSMB5P28074 263 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MAGEA8P43361 318 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TRIM73Q86UV7 250 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FUZQ9BT04 418 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 C5AR2Q9P296 337 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MKLN1Q9UL63 735 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MYO10Q9HD67 2058 aa14.48□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ARHGAP33O14559 1287 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLC28A2O43868 658 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 KIAA0513O60268 411 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ENTPD6O75354 484 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CLEC3AO75596 197 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 MED26O95402 600 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PCCBP05166 539 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DRD2P14416 443 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TP53BP2Q13625 1128 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 NRTNQ99748 197 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 POLE4Q9NR33 117 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 EHD3Q9NZN3 535 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 TBX1O43435 398 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OR1F1O43749 312 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SCG5P05408 212 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 GJA8P48165 433 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 XKP51811 444 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 NCF4Q15080 339 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 RNLSQ5VYX0 342 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 STEAP3Q658P3 488 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 CASP12Q6UXS9 341 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 DEF8Q6ZN54 512 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 LGR4Q9BXB1 951 aa14.47□□□□□ -0.09
HDAC5-211ENST00000592385 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms