RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ACKR4Q9NPB9 350 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT5O00445 386 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PROM1O43490 865 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC1P48995 793 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT3P56703 355 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLAMF1Q13291 335 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 C18orf63Q68DL7 685 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MED27Q6P2C8 311 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC20BQ86Y33 519 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF175Q8N4F7 328 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC15A4Q8N697 577 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM13CQ8NE31 585 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 GAL3ST4Q96RP7 486 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3GL2Q99962 352 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CD244Q9BZW8 370 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51B5Q9H339 312 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPB2A8KAH6 182 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO45P0C2W1 286 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP5P22003 454 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HERVK_113P63132 956 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-8P63133 956 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PLIN5Q00G26 463 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPB2Q16082 182 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CHSY3Q70JA7 882 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TNIP2Q8NFZ5 429 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7G3Q8NG95 312 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ART5Q96L15 291 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR22Q99680 433 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-6Q9BXR3 956 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 QPCTLQ9NXS2 382 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CNIH4Q9P003 139 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF112Q9ULX5 631 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-19Q9WJR5 959 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NNC1 897 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DYRK3O43781 588 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 STMN1P16949 149 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF17Q02223 184 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 FLYWCH1Q4VC44 716 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C11Q6IEV9 310 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 LIX1Q8N485 282 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2E3Q969T4 207 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTM7Q96FZ5 175 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP8Q99708 897 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRT3Q9NQL9 472 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DLL4Q9NR61 685 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLCQ9ULV8 474 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DNASE1P24855 282 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SSTR1P30872 391 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX19P40855 299 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ASCL1P50553 236 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR180Q86V85 440 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DOHHQ9BU89 302 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 WWTR1Q9GZV5 400 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A12Q9NXJ0 267 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 WASHC1A8K0Z3 465 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP1O14494 284 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DVL2O14641 736 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPSP04118 112 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF1P27539 372 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB3P29508 390 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB1P30740 379 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLBQ13191 982 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP8Q13202 625 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 EBPQ15125 230 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 POMZP3Q6PJE2 187 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CREG2Q8IUH2 290 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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