RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF503Q96F45 646 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LYSMD1Q96S90 227 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DECR2Q9NUI1 292 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PADI1Q9ULC6 663 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.33□□□□□ -1.24
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM202A6NGA9 273 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 INPP4BO15327 924 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HCRTR2O43614 444 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A17O43808 307 aa7.32□□□□□ -1.24
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ATG4D-210ENST00000588972 ITGB6P18564 788 aa7.32□□□□□ -1.24
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ATG4D-210ENST00000588972 PDXPQ96GD0 296 aa7.32□□□□□ -1.24
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ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.32□□□□□ -1.24
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ATG4D-210ENST00000588972 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RYKP34925 604 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PTGER1P34995 402 aa7.31□□□□□ -1.24
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ATG4D-210ENST00000588972 TRIM23P36406 574 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 GRIA1P42261 906 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CENPAP49450 140 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA1024LP59773 190 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CDK3Q00526 305 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DPTQ07507 201 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FOXE3Q13461 319 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf61Q13536 156 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.31□□□□□ -1.24
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