RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51B5Q9H339 312 aa24.13■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC23A2Q9UGH3 650 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 AQP9O43315 295 aa24.12■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL18O94889 574 aa24.12■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 A8MVJ9 347 aa24.12■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35A5Q9BS91 424 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa24.11■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PRB8 838 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR19A6NJB7 356 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 CRB2Q5IJ48 1285 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 FAHD1Q6P587 224 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 ISOC1Q96CN7 298 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 VNN3Q9NY84 501 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf47O95873 294 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 IL17FQ96PD4 163 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 EPS8L2Q9H6S3 715 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TAC3Q9UHF0 121 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC3AO75596 197 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ARAFP10398 606 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGAP37287 484 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TMBIM6P55061 237 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 CD47Q08722 323 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB39AQ14964 217 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB133Q30KQ1 61 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 HS3ST5Q8IZT8 346 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13F1Q8NGS4 319 aa24.08■■□□□ 1.45
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