RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	COX14	Q96I36	57 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ASB8	Q9H765	288 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	PAK5	Q9P286	719 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	PTPRB	P23467	1997 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A0G2JNG1	304 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	QSOX1	O00391	747 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	EBAG9	O00559	213 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KLK10	O43240	276 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIAP1	O43715	76 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	LIAS	O43766	372 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KCNJ13	O60928	360 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	MTX2	O75431	263 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TNFSF15	O95150	251 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	AP2A1	O95782	977 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	AGT	P01019	485 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FGG	P02679	453 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	APRT	P07741	180 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	DDC	P20711	480 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CPT2	P23786	658 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	GABRB3	P28472	473 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	GGT5	P36269	586 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CASP3	P42574	277 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	FASLG	P48023	281 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	DIO1	P49895	249 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ARFIP2	P53365	341 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CCL7	P80098	99 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CCZ1B	P86790	482 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	NPRL3	Q12980	569 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	NFATC2	Q13469	925 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KRT33B	Q14525	404 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	IHH	Q14623	411 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	POU6F1	Q14863	301 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms