RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF10BO14763 440 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 GRM2Q14416 872 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 GTF2F2P13984 249 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 RFC2P35250 354 aa20.45■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 GLYATL1Q969I3 302 aa20.45■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.44■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 ASPGQ86U10 573 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 MGLLQ99685 303 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 SRRDQ9UH36 339 aa20.44■□□□□ 0.86
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