RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 FDCSPQ8NFU4 85 aa30.95■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGLN2Q96KS0 407 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa30.95■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL29Q96CT2 875 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP25Q9NPA2 562 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR83Q9NYM4 423 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTS2RQ9UKP6 389 aa30.94■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35E2P0CK97 266 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCKDHAP12694 445 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNAB2Q13303 367 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR14A16Q8NHC5 309 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A23Q9BV35 468 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10H2O60403 315 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EMX2Q04743 252 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TSSK3Q96PN8 268 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIEF1Q9NQG6 463 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf105B2RV13 164 aa30.92■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRPS2P11908 318 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNSP34059 522 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-8P63133 956 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL23RQ5VWK5 629 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIX1Q8N485 282 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMER2Q8N7J2 671 aa30.92■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD17AQ96GS6 310 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASIC5Q9NY37 505 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYRK3O43781 588 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPMP14384 443 aa30.91■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RAPSNQ13702 412 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM47EQ6ZV65 393 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.542e-7■□□□□ 8.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT9Q9BW91 350 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGSF10Q6WRI0 2623 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PS29 197 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGAMP11215 1152 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFTPCP11686 197 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 LBPP18428 481 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 TICAM1Q8IUC6 712 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXD3Q8N9H8 876 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 APCDD1LQ8NCL9 501 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELP5Q8TE02 316 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R7Q9NYW3 318 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 USH1CQ9Y6N9 552 aa30.9■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF195O14628 629 aa30.89■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR143P51810 404 aa30.89■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLHC1Q8NHS4 586 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMF1Q92530 271 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIT1Q92963 219 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF681Q96N22 645 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIMAP4Q9NUV9 329 aa30.89■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF750Q32MQ0 723 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 OGFOD2Q6N063 350 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTN3Q6NUS6 607 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 VMP1Q96GC9 406 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGAP4Q96P64 663 aa30.88■■■□□ 2.53
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