RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ELOC	Q15369	112 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	EFNB3	Q15768	340 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	HSPB2	Q16082	182 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	VASH2	Q86V25	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NAT6	Q93015	286 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PISD	Q9UG56	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	LRBA	P50851	2863 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CENPE	Q02224	2701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	MFSD11	O43934	449 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PALM	O75781	387 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	EML2	O95834	649 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CD48	P09326	243 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ALPI	P09923	528 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CDH1	P12830	882 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CCL4	P13236	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PRKCI	P41743	596 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CSNK1D	P48730	415 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	AIF1	P55008	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	UCN	P55089	124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	OR1D5	P58170	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CDK3	Q00526	305 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RAD51	Q06609	339 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM14	Q14142	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	STX1A	Q16623	288 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NUS1	Q96E22	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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