RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS4AQ9UN37 437 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CFL2Q9Y281 166 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GABRR3A8MPY1 467 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 WDPCPO95876 746 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GBAP04062 536 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MAPK1P28482 360 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ETV4P43268 484 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CYB561P49447 251 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HHATQ5VTY9 493 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KANK2Q63ZY3 851 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SHISA5Q8N114 240 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 BEST3Q8N1M1 668 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM156Q8N614 296 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 EHD3Q9NZN3 535 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP10Q9P2G4 905 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PRAMEF2O60811 474 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HSPA4LO95757 839 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINE1P05121 402 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HTR6P50406 440 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SSR4P51571 173 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 XKP51811 444 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MLF1P58340 268 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CASP8Q14790 479 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NUBPLQ8TB37 319 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL29Q96CT2 875 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MECRQ9BV79 373 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C1orf109Q9NX04 203 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GLOD5A6NK44 160 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SEC22BO75396 215 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLITRK5O94991 958 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 WISP1O95388 367 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CPMP14384 443 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CD97P48960 835 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ALDH9A1P49189 494 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HLCSP50747 726 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR143P51810 404 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXA1P55317 472 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXK1P85037 733 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HMGCS1Q01581 520 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ID2Q02363 134 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BTKQ06187 659 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBA3CQ13748 450 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NR6A1Q15406 480 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HDXQ7Z353 690 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DDIASQ8IXT1 998 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC15A4Q8N697 577 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BCORP1Q8N888 145 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 Q8NA96 180 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MIB2Q96AX9 1013 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ERP27Q96DN0 273 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms