RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ATP1A4Q13733 1029 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 BCL7AQ4VC05 210 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 REEP3Q6NUK4 255 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 NUP43Q8NFH3 380 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 LPGAT1Q92604 370 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 BORCS5Q969J3 196 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SPTSSAQ969W0 71 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ALOX12BO75342 701 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ENGP17813 658 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 EPHA5P54756 1037 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJB13P59910 316 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 CDK6Q00534 326 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ST3GAL4Q11206 333 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TGFBIQ15582 683 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 KCNJ8Q15842 424 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SSR3Q9UNL2 185 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GADD45GO95257 159 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN12O95859 305 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFV2P19404 249 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PBX1P40424 430 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GLP1RP43220 463 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RHDQ02161 417 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SPESP1Q6UW49 350 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 LGI4Q8N135 537 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 COPS4Q9BT78 406 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 R4GN57 208 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GUL6 1792 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 DHRS12A0PJE2 317 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TULP2O00295 520 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 HAT1O14929 419 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RNF13O43567 381 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PGM3O95394 542 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 H6PDO95479 791 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V1B1P15313 513 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MMP12P39900 470 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MARCKSL1P49006 195 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 AP3S2P59780 193 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SHC2P98077 582 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 DPTQ07507 201 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RAPSNQ13702 412 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GPR87Q9BY21 358 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 DOCK2Q92608 1830 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PPW3 197 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PFDN1O60925 122 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 HK1P19367 917 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 COQ8BQ96D53 544 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 BORCS8Q96FH0 119 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 POLE3Q9NRF9 147 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GPR83Q9NYM4 423 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 LHX6Q9UPM6 363 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 ATP12AP54707 1039 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 GFRALQ6UXV0 394 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 SFXN5Q8TD22 340 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms