RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 SCG5P05408 212 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 CKMP06732 381 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 C8GP07360 202 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 TSPAN19P0C672 248 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 MSL3P1P0C860 447 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 TAS2R50P59544 299 aa13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 Q6ZVL8 140 aa13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 PTNP21246 168 aa13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 CTSCP53634 463 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 HYAL1Q12794 435 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 CEACAM20Q6UY09 585 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 PRR14Q9BWN1 585 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 TSSK6Q9BXA6 273 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 IRAK3Q9Y616 596 aa13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.252e-8■■□□□ 11.9
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PRAME-214ENST00000543184 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.5□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 HEPACAM2A8MVW5 462 aa13.5□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 ETV3P41162 512 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 HNMTP50135 292 aa13.5□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.5□□□□□ -0.25
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PRAME-214ENST00000543184 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 SPEGQ15772 3267 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 SGTAO43765 313 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 PRKYO43930 277 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-214ENST00000543184 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.256e-12■■■■■ 39.4
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