RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 CHMP24386 653 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PKLRP30613 574 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 IL12RB1P42701 662 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 RORCP51449 518 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CHRNA6Q15825 494 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PYDC2Q56P42 97 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 C22orf42Q6IC83 251 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SYT12Q8IV01 421 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PGBD3Q8N328 593 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 CRELD1Q96HD1 420 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SLC6A18Q96N87 628 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 BRD9Q9H8M2 597 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 MCUBQ9NWR8 336 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 DEC1Q9P2X7 70 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CFAP54Q96N23 3096 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 FABP12A6NFH5 140 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 A8MUA0 341 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 FZD6O60353 706 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 AP2A2O94973 939 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 IGSF6O95976 241 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 KRT6BP04259 564 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 LAMP2P13473 410 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PTSQ03393 145 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TFF2Q03403 129 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 MTAPQ13126 283 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 P2RY14Q15391 338 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 GPR19Q15760 415 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 MICAQ29983 383 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 LAS2Q8IYD9 372 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 OMA1Q96E52 524 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 DOHHQ9BU89 302 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ASB8Q9H765 288 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 IL17CQ9P0M4 197 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 NLKQ9UBE8 527 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 CIB4A0PJX0 185 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 GASTP01350 101 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TRBC1P01850 177 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SCG5P05408 212 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 EPHX1P07099 455 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TSPAN19P0C672 248 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PSMA3P25788 255 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 OPRD1P41143 372 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ADAM15Q13444 863 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ZNF234Q14588 700 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 QPRTQ15274 297 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 YAF2Q8IY57 180 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ENKURQ8TC29 256 aa8.68□□□□□ -1.02
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THBS3-211ENST00000541990 ARL15Q9NXU5 204 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 MAFFQ9ULX9 164 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 K7ESM1 405 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PLOD3O60568 738 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PRAMEF10O60809 474 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 ETHE1O95571 254 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-211ENST00000541990 PRPS2P11908 318 aa8.68□□□□□ -1.02
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