RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	CYP3A5	P20815	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HOXD10	P28358	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CHRNA3	P32297	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GLIPR1	P48060	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MAPK12	P53778	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	OGDH	Q02218	1023 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RBPJ	Q06330	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MGAT3	Q09327	533 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CUL1	Q13616	776 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RAD9A	Q99638	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	EGFL8	Q99944	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	PTGES	O14684	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	SLC22A2	O15244	555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	TTI1	O43156	1089 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	CABYR	O75952	493 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	APOA4	P06727	396 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	KRT3	P12035	628 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	CDH3	P22223	829 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	MAP2K2	P36507	400 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	LIMK1	P53667	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	PMP22	Q01453	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	DR1	Q01658	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	KLC1	Q07866	573 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	CUL3	Q13618	768 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	TEAD2	Q15562	447 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	TAZ	Q16635	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS13-208	ENST00000531908	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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